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依據文學與哲學的研究領域，建構系統化的知識樹。本區將館藏歸納於不同的學術脈絡之下，協助研究者在特定的思想體系或學科範疇中，進行深度挖掘與主題式探討。
蒐集、整理明清詞學及戲曲方面之相關資料，成立「明清文學研究室」，與國際的明清研究接軌
結合國內外相關學者，以比較文學和比較文化的方法研究近現代以來的中國文學和台灣文學
以收集清代和民國時期經學文獻為主，包括經學常用工具書、經學學位論文，執行研究計畫所需的文獻資料等
關注中國哲學的現代詮釋，尤其在現代議題上，擬與西方思潮對話，例如政治哲學、環保思潮、科技哲學等，彰顯中國哲學的當代性
旨在於推動當代儒學研究計畫，蒐集有關當代儒學研究之相關資料，致力於從東亞與世界的角度推動哲學的對話與思想的創
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